علامت گذاری ملکه برای یافتن سریع ملکه در کندوچه جفت‌گیری و نیز برای مشخص شدن سن ملکه انجام می‌شود. گاهی از شماره‌گذاری برای مشخص شدن شجره ملکه استفاده می‌کنند.
کوتاه کردن بال ملکه، شیوه رایج علامت‌گذاری روی ملکه برای مشخص شدن سن آن است. علامت‌گذاری روی ملکه با رنگ یا لاک مخصوص انجام می‌شود. برای این کار معمولاً از رنگ‌هایی استفاده می‌شود که بی‌بو باشند، سریعاً خشک شوند و بادوام و پایدار باشند. از لاک ناخن یا رنگ بدنه اتومبیل نیز برای این کار استفاده می‌کنند.
معمولاً قسمت پشتی قفس سینه و گاهی روی شکم ملکه علامت گذاری می‌شود.

2imhxnyohy26zmpmnkm
گاهی نیز با استفاده از دیسک‌های شماره دار به رنگ‌های گوناگون سن ملکه زنبور عسل و شجره آن مشخص می‌گردد. این دیسک‌ها با چسب خاص در قسمت قفس سینه ملکه چسبانده می‌شود. دیسک‌ها محدب هستند و به آسانی روی قفسه سینه ملکه جاگذاری می‌شوند.